フォトショップのファイルを読み込む際、
「フッテージ」で読み込むと、全てのレイヤーを統合したものか、一つのレイヤーのみの読み込みになります。
「コンポジション」を選ぶと、レイヤーごとに全てのレイヤーが独立した状態で別々に読み込めます。
「コンポジション レイヤーをクロップ」を選ぶと、トリミングされて読み込まれます。
参考:After Effects Style|フッテージとコンポジションの違いについて
Photoshopをコンポジションで読み込んだ状態では、レイヤーが同じ時間に重なっています。
これを時間をずらして配置したい場合は、ずらしたい素材を選択し、
右クリックから 「キーフレーム補助」 → 「シーケンスレイヤー」 でできます。
(オーバーラップなど必要に応じて設定すると、切り替わりにフェードなどの効果がつけられたりします)
ちなみに、選択した順番が、配置される順番となるため、
上から下にレイヤーを選択した場合、見た目としては右肩さがりに配置され、
下から上に選択した場合、見た目としては右肩あがりに配置されます。(下の画像参考)